Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Hoxc13P50207 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc13P50207 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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