Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmod1P49813 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms