Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SrprbP47758 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SrprbP47758 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SrprbP47758 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SrprbP47758 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SrprbP47758 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrprbP47758 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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