Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nedd1P33215 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms