Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PrkchP23298 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PrkchP23298 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PrkchP23298 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms