Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Fcer1aP20489 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms