Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TP20293 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TP20293 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TP20293 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TP20293 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TP20293 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TP20293 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TP20293 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TP20293 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TP20293 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TP20293 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TP20293 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TP20293 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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