Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ifrd1P19182 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms