Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PcnaP17918 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcnaP17918 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcnaP17918 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcnaP17918 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcnaP17918 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PcnaP17918 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PcnaP17918 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PcnaP17918 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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