Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms