Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxd4P10628 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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