Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Kcns1O35173 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms