Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms