Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm42421F6X8D5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms