Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CenpfE9Q3P4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CenpfE9Q3P4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms