Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kif28pD3YXS5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms