Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clrn2B2RVW2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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