Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Zbed5B2RPU8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms