Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Tmem235B1AQL3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tmem235B1AQL3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms