Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Hdac5Q9Z2V6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Hdac5Q9Z2V6 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdac5Q9Z2V6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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