Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn8Q9Z260 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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