Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cldn13Q9Z0S4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cldn13Q9Z0S4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cldn13Q9Z0S4 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms