Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Ercc4Q9QZD4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc4Q9QZD4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc4Q9QZD4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc4Q9QZD4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc4Q9QZD4 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ercc4Q9QZD4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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