Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms