Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms