Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Usp29Q9ES63 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Usp29Q9ES63 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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