Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Med27Q9DB40 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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