Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Tmem54Q9D7S1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmem54Q9D7S1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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