Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Nop56Q9D6Z1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nop56Q9D6Z1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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