Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PrameQ9D4Z5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PrameQ9D4Z5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PrameQ9D4Z5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PrameQ9D4Z5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PrameQ9D4Z5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PrameQ9D4Z5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PrameQ9D4Z5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PrameQ9D4Z5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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