Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lonrf3Q9D4H7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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