Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Zbed3Q9D0L1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Zbed3Q9D0L1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed3Q9D0L1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed3Q9D0L1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed3Q9D0L1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed3Q9D0L1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Zbed3Q9D0L1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Zbed3Q9D0L1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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