Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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