Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Cxxc1Q9CWW7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cxxc1Q9CWW7 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms