Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tdrd1Q99MV1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms