Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lims1Q99JW4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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