Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ddb2Q99J79 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms