Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Cldn16Q925N4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cldn16Q925N4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
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