Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Srsf4Q8VE97 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms