Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CcsapQ8QZT2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms