Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Abcf3Q8K268 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Abcf3Q8K268 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Abcf3Q8K268 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Abcf3Q8K268 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Abcf3Q8K268 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Abcf3Q8K268 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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