Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hpf1Q8CFE2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hpf1Q8CFE2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms