Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp40Q8BWR4 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp40Q8BWR4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp40Q8BWR4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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