Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Atg4bQ8BGE6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms