Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms