Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ChfrQ810L3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms