Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL3

Prickle3, Prickle planar cell polarity protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle3Q80VL3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Prickle3Q80VL3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms