Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

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Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Clec16aQ80U30 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec16aQ80U30 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Clec16aQ80U30 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Clec16aQ80U30 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Clec16aQ80U30 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Clec16aQ80U30 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clec16aQ80U30 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Clec16aQ80U30 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms