Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trak1Q6PD31 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms