Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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NipblQ6KCD5 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
NipblQ6KCD5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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